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16.陸軍軍醫大學第一附屬醫院:大數據驅動的臨床智能輔診系統研發與應用【CHIMA 2019案例分享】

發布時間:2019-06-13
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案例提供:陸軍軍醫大學第一附屬醫院

案例概要


近年來,大數據已變成驅動我們數字生活發展的動力和未來科技創新的重要方向,特別是醫療健康領域的大數據具有廣泛的應用潛力。陸軍軍醫大學第一附屬醫院基于醫院海量真實病例數據,結合醫學文獻、臨床指南、專病庫等知識庫,研發了大數據驅動的臨床智能輔診系統,為醫生診療過程提供多維度數據的輔助決策。


系統充分利用大數據技術,對海量醫療數據進行采集、存儲、清洗、語義分析、后結構化處理,并對診療過程具有重要參考價值的用藥知識、診療知識、臨床指南和醫學文獻等數據進行多元化的處理與集成,力求為醫生提供全景式的客觀數據展示與知識參考。通過及時、有效地建立大數據驅動的知識體系,突破數據集成技術的難點與限制,形成安全有效的大數據驅動的新型精準診療模式臨床應用范式,突破醫療大數據分析方法與應用的制約點,形成了在臨床智能輔助方面有價值的應用,實現覆蓋診療過程的實時輔助診療決策,有效降低誤診率,提升臨床診療水平及效率。


解決問題


在大數據時代,數據更新之迅速遠遠超出了個人的學習和接受能力,大量新的醫學論文發表,新的臨床研究數據發布,令臨床醫生應接不暇。當前,從醫療大數據的處理到利用還需迫切解決以下問題。


1.醫院已積累的海量醫療數據缺乏有效深度利用。


絕大多數醫院經過近二十年醫療信息化的發展積累,形成了大量結構化和非結構化的數據,且隨著可穿戴設備監測數據、基因測序數據等新模態數據的出現,醫療大數據的增長更為迅猛。然而,醫院臨床數據的利用水平不高,絕大部分數據處于“沉睡”狀態,不能進行臨床決策支持與科研,更沒有對數據進行知識發現并轉化為知識。


2.現有信息環境難以滿足診療過程中的知識需求。


現有診療過程中,醫生對輔助知識的獲取方式和內容都非常匱乏,特別鮮見使用廣泛的醫學知識推薦和查詢,且缺少實用的知識服務手段。而實質上,臨床診療工作中,有大量的知識需求亟待通過計算機來提供,這其中就包括基礎知識庫、臨床診療知識庫、參考文獻和從歷史病例挖掘形成的知識。


3.傳統技術手段不能支撐智能、高效的知識獲取方式。


傳統數據處理的技術手段只能應對相對少量的醫學數據,如果醫生在診療過程中獲取知識的效率太低,醫生一般都會選擇盡可能少用。因此,我們需要利用最新的醫療大數據技術,構建一套高效的知識獲取系統,實現對醫生知識需求的快速響應,并盡可能做到智能化,即能夠智能感知診療過程,精準的為醫生提供知識服務。


數據內容


臨床智能輔診系統,是基于我院醫療大數據平臺和醫院海量真實病歷數據,結合醫學文獻、臨床知識庫等資源,利用分布式存儲和計算、自然語言處理、機器學習等技術構建的,深入挖掘醫院近20年累積的大量優質歷史病歷數據,并融合醫學知識庫,涵蓋文獻、指南、循證醫學證據,系統囊括了8種癌癥的臨床指南,1070余條醫學知識規則,可鏈接近2000萬份電子病歷文檔資料和400多萬篇文獻摘要及70多萬篇文獻全文。


系統架構如圖1所示,包括在線智能引擎架構、離線數據處理架構兩部分。


圖1 臨床決策支持系統系統架構


其中數據源來自我院大數據平臺和鏈接的各類知識庫文獻庫等,系統通過CDSS引擎模塊調取數據。在線智能引擎部分主要負責根據醫生實時輸入,通過實時處理計算,完成診療行為推薦、相似病歷統計、檢索等功能,并將結果展示給醫生,該模塊在客戶端包含輔助決策客戶端程序,服務端包含CDSS引擎模塊。離線數據處理部分主要按照一定周期或人工觸發后,獲取海量臨床病歷、文獻知識等原始數據,按照算法設計的規則清洗數據,提取關鍵信息,并訓練算法模型,使得在線系統可以調用算法模型實現特征提取和診療行為推薦。

關鍵技術


1.醫療大數據集成與處理基礎技術


將醫院HIS、EMRS、LIS、PACS 等醫療數據通過ETL工具進行抽取、匯集、結構化,映射到兼容國際國內醫療數據規范標準的全局Schema中,對字段信息清洗和語義歸一,為上層應用服務提供準確的基礎數據支撐和業務模型訓練。采用了Hadoop技術框架搭建分布式計算,利用22臺服務器組建大數據處理平臺,共225T存儲空間,進行數據采集、清洗、處理、存儲等工作。


2.多元異構醫學數據的后結構化處理與分析技術


通過自然語義處理技術,結合醫療專業術語的語義結構,將醫療語義信息從原始的自然語言表達,擴展分析為結構化的Key-Value模式,為后續的應用、挖掘、機器學習提供基礎數據支持。對2600多萬份病歷數據建立臨床專業語料庫,構建數據索引,并進行結構化與歸一化處理,為大數據應用、挖掘、機器學習提供結構化數據。


3.構建診療過程知識生成的智能算法與規則體系


采用聚類、分類、協同過濾、推薦等算法分析數據結構,對不同的醫學數據進行標注,進而建立分類數據集;再結合數據集和機器訓練,達到新數據自動識別與歸類的目的,進而為臨床診療活動挖掘出符合條件的業務模型和知識服務。結合醫學數據集結構化字段5792個,通過機器學習實現結構化字段的自定義,拓展符合特定診療場景的知識服務。


4.研發大數據驅動的臨床智能輔診系統


基于醫院海量真實病歷數據,結合醫學文獻、臨床指南、專病庫等知識庫,研發了大數據驅動的臨床智能輔診系統。系統自動獲取患者就診信息,并為醫生診療過程提供多維度數據的輔助決策,提供操作便捷、實用高效的輔助工具,與醫生工作站進行融合。


應用成果


面向臨床醫生的輔助決策和推薦系統,支持自動從醫生工作站獲取當前就診的患者信息,多維度為醫生診療過程提供輔助決策,讓醫生在傳統的診療環境獲得創新的診療手段。


1.診斷推薦


根據患者基本信息和主訴、現病史等臨床信息,智能推薦疑似診斷,并提供這些診斷的典型癥狀、常用檢查、常用檢驗以及歷史相似病歷,如圖2所示。


圖2 診斷推薦示意圖


2.檢查檢驗推薦


根據初步診斷,結合基本信息、一訴五史,自動推薦適合的檢驗、檢查項目,并挖掘展示歷史病歷中的開立占比及相關文獻,如圖3所示。


圖3 檢查檢驗推薦示意圖


3.治療方案推薦


根據最終診斷自動推薦最佳治療方案,并挖掘展示各治療方案在歷史病歷中的開立占比及相關文獻,如圖4所示。


圖4 治療方案推薦示意圖


4.智能提醒


結合知識庫和知識挖掘,智能提醒不適合患者病情的處置和預警,如圖5所示。


圖5 智能提醒示意圖


5.病歷分析


根據患者主訴、現病史、診斷、檢查檢驗、用藥等信息,基于歷史數據找出相似病歷及各維度的統計數據,如圖6所示。


圖6 病歷分析示意圖


6.知識搜索


提供最新最全醫學文獻、臨床指南、臨床路徑等循證醫學知識,如圖7所示。


圖7 知識搜索示意圖


應用成效


本案例研發的大數據驅動的臨床智能輔診系統,突破了醫療大數據分析方法與應用的制約點,為終端用戶提供了功能較實用、簡便圖形化界面的診療決策輔助工具,形成了在臨床智能輔助方面有價值的應用,對精準醫療的進一步實施與實現具有有價值的參考意義。截止目前,系統已在醫院各臨床科室推廣使用,已累計為醫生診療行為服務8萬多人次,為臨床醫生和患者帶來了較好的就診體驗。


首先,臨床智能輔診對臨床醫生特別是年輕醫生、臨床實習生和輪轉醫生都有很好的指導作用,可以讓他們學習已經積累的先進經驗,并可同時了解到國內外研究進展與治療規范,幫助其在臨床工作過程中不斷提升診療水平。


其次,基于醫療大數據的智能輔診應用會使醫生的診療過程更加科學、合理、精準;特別是形成了更加有針對性的檢查、用藥和治療方案,可進一步減輕患者負擔,節約就診時間,也可進一步提升臨床工作效率,提升床位周轉率。


再次,該系統的研發大大提升了臨床診療的信息化環境水平,通過大數據、人工智能等相關技術的集成與應用,使得醫院臨床診療信息化向智慧醫療、精準診療方向進一步探索,形成了新技術應用的知識儲備。


下一步計劃


將臨床智能輔診系統深度融合到診療流程中,不斷擴充、完善包括影像、生物樣本庫等在內的各類醫療數據,進一步利用大數據與人工智能技術提升系統的智能化與親和度,提高整體輔診能力。


同時,此系統可進一步拓展應用到各基層醫療機構,實現將大型醫療機構的豐富臨床經驗與知識輻射到基層,對提升基層醫生的診療水平,帶動區域內整體醫療水平的進步具有十分重要的參考價值,市場前景也較廣闊。



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