馮嵩:醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)賦能臨床科研一體化
始建于1906年的中南大學(xué)湘雅醫(yī)院(以下簡稱“湘雅醫(yī)院”)是國家衛(wèi)生健康委員會直管的三級甲等綜合醫(yī)院,是我國建立健全現(xiàn)代醫(yī)院管理制度試點醫(yī)院之一,擁有3500張床位。醫(yī)院于2019年開始著力打造臨床科研一體化平臺。“大數(shù)據(jù)是智慧醫(yī)院建設(shè)非常重要的一部分,我們要強化數(shù)據(jù)資源建設(shè),著力推進基于大數(shù)據(jù)的相關(guān)應(yīng)用,支撐醫(yī)院科研、臨床應(yīng)用、醫(yī)院管理需求,推動醫(yī)院高質(zhì)量和可持續(xù)發(fā)展。”湘雅醫(yī)院信息中心主任馮嵩談到。
《全國醫(yī)院信息化建設(shè)標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范(試行)》提出,要利用數(shù)據(jù)中心的大數(shù)據(jù)資源,對醫(yī)療服務(wù)、科研管理、醫(yī)院治理等的輔助決策支撐應(yīng)用。“研究型醫(yī)院的建設(shè)需要發(fā)揮數(shù)據(jù)價值,同時臨床科研、特別是多中心臨床研究需要數(shù)據(jù)的支撐。在使用數(shù)據(jù)前,需要先對數(shù)據(jù)進行結(jié)構(gòu)模型轉(zhuǎn)換、代碼轉(zhuǎn)換、數(shù)據(jù)清洗、數(shù)據(jù)歸約、實體提取等相應(yīng)處理。”馮嵩認(rèn)為,為保障數(shù)據(jù)合理、合規(guī)利用,醫(yī)院應(yīng)該按照國家法律和行業(yè)法規(guī),建立數(shù)據(jù)安全標(biāo)準(zhǔn)體系、數(shù)據(jù)分類分級保護制度、數(shù)據(jù)安全審查制度和數(shù)據(jù)安全應(yīng)急處置機制等。
設(shè)置大數(shù)據(jù)中心架構(gòu)
在馮嵩看來,數(shù)據(jù)既要可用也要保證其全程可控,基于此湘雅醫(yī)院建設(shè)了“3321”大數(shù)據(jù)共享協(xié)作平臺:第一個3是指三大應(yīng)用中心,分別是網(wǎng)絡(luò)信息與大數(shù)據(jù)中心、臨床研究方法學(xué)中心、數(shù)據(jù)挖掘與應(yīng)用中心;第二個3是指三大數(shù)據(jù)來源,分別是醫(yī)院臨床數(shù)據(jù)、專病隊列數(shù)據(jù)和協(xié)作機構(gòu)數(shù)據(jù);2是指兩大資源,分別是臨床實驗資源和生物樣本資源;1是指一張“共建、共治、共享”的科研協(xié)作創(chuàng)新網(wǎng)絡(luò)。
在湘雅醫(yī)院,三大中心協(xié)同工作,共同承建數(shù)據(jù)的使用和管理,為臨床提供數(shù)據(jù)支撐:網(wǎng)絡(luò)信息與大數(shù)據(jù)中心以醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)采集、匯聚和質(zhì)控管理為核心,為國家老年疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心的多中心臨床研究項目提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ),并負(fù)責(zé)臨床數(shù)據(jù)管理、一站式科研支撐、多中心科研協(xié)作等公共平臺的建設(shè)和管理。臨床研究方法學(xué)中心組織合作院校的統(tǒng)計學(xué)和流行病學(xué)專家形成專家團隊,在平臺的支持下通過數(shù)據(jù)特征分析、病歷智能檢索等功能,為臨床研究人員提供專業(yè)、詳實的指導(dǎo)。數(shù)據(jù)挖掘與應(yīng)用中心成立了多學(xué)科交叉的研究團隊,擁有先進的軟硬件設(shè)備,為臨床醫(yī)學(xué)相關(guān)研究提供大規(guī)模科學(xué)運算和數(shù)據(jù)分析服務(wù),面向全球及協(xié)同創(chuàng)新聯(lián)盟成員單位開放共享。“我們構(gòu)建了數(shù)據(jù)中心,匯聚了院內(nèi)信息系統(tǒng)、聯(lián)盟醫(yī)院和區(qū)域平臺、設(shè)備數(shù)據(jù)等為來源的930多萬患者數(shù)據(jù),按不同主題對數(shù)據(jù)進行清洗、質(zhì)控及數(shù)據(jù)治理后,形成了臨床數(shù)據(jù)中心、科研數(shù)據(jù)中心、運營數(shù)據(jù)中心等,支撐醫(yī)療、管理、科研等應(yīng)用。”馮嵩表示。
湘雅醫(yī)院在進行數(shù)據(jù)中心建設(shè)時,首先確定了數(shù)據(jù)來源,把整個院內(nèi)數(shù)據(jù)匯總到一起,形成資源中心。“通過整合患者和疾病全生命周期的數(shù)據(jù),從臨床業(yè)務(wù)系統(tǒng)或匯聚庫經(jīng)過標(biāo)化處理后,根據(jù)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)建立的數(shù)據(jù)模型進行存儲,主要的數(shù)據(jù)域包括門急診患者全量醫(yī)療數(shù)據(jù)、住院患者全量醫(yī)療數(shù)據(jù)、生物樣本庫數(shù)據(jù)、醫(yī)療設(shè)備和儀器數(shù)據(jù)、聯(lián)盟醫(yī)院全量數(shù)據(jù)、穿戴設(shè)備全量數(shù)據(jù)等。”馮嵩介紹。
為方便對數(shù)據(jù)進行研究分析,湘雅醫(yī)院根據(jù)類別對診斷、手術(shù)等數(shù)據(jù)按病種進行統(tǒng)一的歸一化,支持各種維度的檢索和分析。在數(shù)據(jù)質(zhì)控方面,湘雅醫(yī)院形成了完整的質(zhì)控流程,每天會形成相應(yīng)的質(zhì)控報表,通過不斷質(zhì)控發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)問題,然后再根據(jù)問題反饋到數(shù)據(jù)產(chǎn)生源頭整改,并動態(tài)完善質(zhì)控規(guī)則,從而保障數(shù)據(jù)質(zhì)量。為保障數(shù)據(jù)的安全,湘雅醫(yī)院建立了一套完整、可追溯的數(shù)據(jù)血緣體系,從數(shù)據(jù)的使用端可以清晰的關(guān)聯(lián)到數(shù)據(jù)的生產(chǎn)端,保證數(shù)據(jù)的全程可追溯。
構(gòu)建大數(shù)據(jù)應(yīng)用體系
馮嵩強調(diào),湘雅醫(yī)院非常重視加強數(shù)據(jù)使用過程中的風(fēng)險防控,特別強調(diào)對數(shù)據(jù)使用者的監(jiān)管,所有流通環(huán)節(jié)都有據(jù)可查。
湘雅醫(yī)院統(tǒng)一管理全平臺用戶權(quán)限,管理后臺集成了訪問權(quán)限設(shè)置、角色設(shè)置、導(dǎo)出管控等模塊:訪問權(quán)限設(shè)置支持統(tǒng)一分配數(shù)據(jù)庫的訪問權(quán)限到具體的用戶;角色設(shè)置支持根據(jù)功能使用需求,給不同用戶在不同庫靈活設(shè)置不同的角色;導(dǎo)出管控支持后臺統(tǒng)一管理無導(dǎo)出權(quán)限用戶的數(shù)據(jù)導(dǎo)出申請。對此,馮嵩談到:“我們對所有大數(shù)據(jù)平臺的用戶權(quán)限使用進行了統(tǒng)一管理,同時大平臺本身也會提供全流程的功能支撐,并且具備標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)分析能力。”如果醫(yī)生想借助數(shù)據(jù)進行科研,可先申請一個賬號,查詢到所有的數(shù)據(jù)資源。如果相關(guān)數(shù)據(jù)滿足醫(yī)生的科研需求,由醫(yī)生上報給數(shù)據(jù)管理委員會,提供研究思路、數(shù)據(jù)范圍、倫理審批等資料后,數(shù)據(jù)管理委員會組織答辯,通過后按科研項目管理提供數(shù)據(jù)并在醫(yī)院內(nèi)的安全環(huán)境內(nèi)使用。
依托大數(shù)據(jù)共享協(xié)作平臺,湘雅醫(yī)院牽頭國家重點研發(fā)計劃項目共11項,開展科研課題75項,建成臨床隊列23個,包括全國首個老年骨關(guān)節(jié)疾病領(lǐng)域大樣本自然人群隊列、全國最大的家族性帕金森病和早發(fā)型帕金森病隊列、全國人群地域分布最廣泛的老年皮膚病隊列。
在談及下一步工作思路時,馮嵩表示:“大數(shù)據(jù)將進一步支撐我們的基礎(chǔ)研究、臨床與產(chǎn)業(yè)一體化協(xié)同發(fā)展,相互助力,形成以基礎(chǔ)創(chuàng)新研發(fā)為主導(dǎo)的 ‘產(chǎn)學(xué)研用’互動格局。同時計劃建立全病種數(shù)據(jù)庫平臺,在多個數(shù)據(jù)庫之間實現(xiàn)數(shù)據(jù)的統(tǒng)一和共享。”