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鄭林:醫(yī)療數(shù)據(jù)統(tǒng)一歸檔應(yīng)用的探索與實(shí)踐

發(fā)布時(shí)間:2024-01-24
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清華大學(xué)附屬北京清華長(zhǎng)庚醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱“清華長(zhǎng)庚醫(yī)院”)于2014年11月28日開業(yè),是一所由清華大學(xué)與北京市共建共管的大型綜合性公立醫(yī)院,目前成立7大醫(yī)療部和50余個(gè)臨床醫(yī)技專科,總體規(guī)劃1500張床,二期項(xiàng)目正在建設(shè)當(dāng)中,預(yù)計(jì)2024年投入使用。“醫(yī)院采取醫(yī)療與行政分工協(xié)同治理體制、整合式醫(yī)療模式、Attending醫(yī)師負(fù)責(zé)制、全責(zé)護(hù)理模式,建立了全流程、全覆蓋的醫(yī)療信息系統(tǒng)。”清華長(zhǎng)庚醫(yī)院信息管理部臨床醫(yī)療組組長(zhǎng)鄭林談到,醫(yī)院信息系統(tǒng)以自研為主,全面支撐臨床和管理對(duì)信息化提出的需求。

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劃分?jǐn)?shù)據(jù)類型

為滿足臨床業(yè)務(wù)需求,增強(qiáng)HIS的穩(wěn)定性,提高HIS的響應(yīng)速度,清華長(zhǎng)庚醫(yī)院開啟了臨床數(shù)據(jù)歸檔工作。

鄭林介紹,清華長(zhǎng)庚醫(yī)院的臨床數(shù)據(jù)歸檔一開始制定了如下目標(biāo):建立統(tǒng)一平臺(tái)(CDR),為臨床提供一套統(tǒng)一的查閱病歷的數(shù)據(jù)平臺(tái);以患者為索引的數(shù)據(jù)組織方式,以“患者為中心”來(lái)組織構(gòu)建臨床數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),方便臨床查詢及追蹤患者疾病信息;保障HIS穩(wěn)定與高響應(yīng),將CDR作為臨床數(shù)據(jù)長(zhǎng)期留存的場(chǎng)所,減輕業(yè)務(wù)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)負(fù)荷,提升穩(wěn)定性及響應(yīng)性;便于管理,通過統(tǒng)一口徑管理進(jìn)出平臺(tái)的數(shù)據(jù),使實(shí)際操作更便捷,管理上更有效。

清華長(zhǎng)庚醫(yī)院為臨床數(shù)據(jù)歸檔設(shè)置了整個(gè)架構(gòu),分為三部分:一是數(shù)據(jù)歸檔,二是權(quán)限管理,三是界面展示。

鄭林介紹,數(shù)據(jù)歸檔是CDR歸檔過程中最核心的功能,主要作用是將臨床數(shù)據(jù)從臨床業(yè)務(wù)系統(tǒng)中經(jīng)過數(shù)據(jù)治理,把數(shù)據(jù)插入到CDR數(shù)據(jù)庫(kù)中,整個(gè)過程中分為三部分進(jìn)行:第一部分,確定數(shù)據(jù)類型和業(yè)務(wù)范圍;第二部分,對(duì)獲取數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)治理;第三部分,將數(shù)據(jù)治理的數(shù)據(jù)插入到CDR數(shù)據(jù)庫(kù)中。

在進(jìn)行數(shù)據(jù)歸檔前,鄭林和同事首先要確定臨床數(shù)據(jù)的類型,經(jīng)過梳理醫(yī)院數(shù)據(jù)庫(kù),按照數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)方式分為兩類:數(shù)據(jù)庫(kù)和文件類型。其中,數(shù)據(jù)庫(kù)有兩類:結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),主要是生命體征、醫(yī)囑、處方、檢驗(yàn)結(jié)果、部分檢查結(jié)果等;非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),此部分主要是醫(yī)護(hù)在診療過程中,手動(dòng)錄入的數(shù)據(jù),如護(hù)理記錄、檢查報(bào)告等。文件有三類:XML文件,以電子病歷為主的病歷文書、會(huì)診、各類評(píng)估表單、患者簽署的知情同意書等;PDF文件,設(shè)備直出的報(bào)告、第三方系統(tǒng)表單,如麻醉記錄單等;醫(yī)療圖像,包括放射科影像、PACS、內(nèi)窺鏡、病理圖片等圖像資料。

采取不同歸檔策略

“針對(duì)不同的數(shù)據(jù)類型,我們采取的數(shù)據(jù)歸檔策略是不一樣的。”鄭林談到。

其中,數(shù)據(jù)庫(kù)中的醫(yī)囑、檢查檢驗(yàn)報(bào)告、處方等各類數(shù)據(jù)全部歸檔到CDR數(shù)據(jù)庫(kù)中。“我們歸檔的所有數(shù)據(jù),都是正式數(shù)據(jù),即醫(yī)生已填完和寫完的電子病歷。醫(yī)生寫病歷過程中未審核的檢查檢驗(yàn)報(bào)告,則未被歸檔。”鄭林介紹,將所有數(shù)據(jù)存到CDR數(shù)據(jù)庫(kù)中后,對(duì)CDR存儲(chǔ)過程分了三部分:最上面是患者索引,主要是將患者的唯一標(biāo)識(shí)做了標(biāo)記,同時(shí)將患者標(biāo)識(shí)與其他數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián);中間是數(shù)據(jù)分類,主要指患者在一次就診過程中產(chǎn)生的很多數(shù)據(jù),比如醫(yī)囑、文件、檢查檢驗(yàn)報(bào)告等,在進(jìn)行存儲(chǔ)前先把這部分?jǐn)?shù)據(jù)進(jìn)行分類,方便把它們插入不同數(shù)據(jù)庫(kù)表中;底下是數(shù)據(jù)存儲(chǔ),采用了Oracle和MongoDB兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。

對(duì)于文件,鄭林和同事分別進(jìn)行了歸檔:XML文件,病歷文書、會(huì)診、各類評(píng)估表單、患者簽署的知情同意書等病歷文書,以文件的路徑進(jìn)行數(shù)據(jù)歸檔;PDF文件,上傳到文件服務(wù)器,同時(shí)歸檔文檔路徑;醫(yī)療圖像,以界面集成的方式實(shí)現(xiàn)歸檔,直接調(diào)用第三方的展示應(yīng)用。

“在我們進(jìn)行數(shù)據(jù)歸檔過程中,整個(gè)設(shè)計(jì)的關(guān)鍵點(diǎn)體現(xiàn)在以下四個(gè)方面:患者的EMPI,保證患者的唯一索引,我院是采用了GUID作為患者唯一標(biāo)識(shí);患者關(guān)聯(lián),存在同一個(gè)GUID下,有多個(gè)患者ID的情況,因此必須要有對(duì)照關(guān)系;按存儲(chǔ)方式區(qū)分,根據(jù)醫(yī)療數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)形式,對(duì)醫(yī)療數(shù)據(jù)進(jìn)行分類,以便進(jìn)行數(shù)據(jù)存儲(chǔ);分類存儲(chǔ),將每一條數(shù)據(jù)賦值唯一ID,并進(jìn)行分類存儲(chǔ)。”鄭林介紹,清華長(zhǎng)庚醫(yī)院的數(shù)據(jù)歸檔實(shí)現(xiàn)了對(duì)獲取的臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)進(jìn)行治理,并按照數(shù)據(jù)格式,插入到CDR數(shù)據(jù)庫(kù)中,同時(shí)結(jié)合醫(yī)院實(shí)際情況,自定義數(shù)據(jù)格式。

鄭林和同事在進(jìn)行數(shù)據(jù)歸檔時(shí),采取了以下業(yè)務(wù)邏輯:第一,獲取數(shù)據(jù),整理數(shù)據(jù);第二,判斷是否存在患者唯一索引,若為新患者,則新增歸檔數(shù)據(jù);第三,判斷項(xiàng)目是否存在;第四,判斷數(shù)據(jù)是否為最新,如果新數(shù)據(jù)大于等于舊數(shù)據(jù),則代表有更新,如果新數(shù)據(jù)小于舊數(shù)據(jù),則代表有作廢。

對(duì)于異常數(shù)據(jù),鄭林及同事采取了以下處理措施:按就診重新歸檔,未能充分核實(shí),造成就診人錯(cuò)誤,例如醫(yī)保信息,對(duì)業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)進(jìn)行重新調(diào)整后全部歸檔;某條記錄進(jìn)行了修改,例如長(zhǎng)期藥囑的,為避免糾紛,提出修改后臺(tái)數(shù)據(jù);歸檔系統(tǒng)異常,在歸檔過程中HIS宕機(jī)或歸檔數(shù)據(jù)宕機(jī),則可重啟;實(shí)時(shí)追蹤,將歸檔日志以短信及郵箱形式發(fā)送給DBA。

據(jù)了解,清華長(zhǎng)庚醫(yī)院此次將2014年11月28日至2023年5月20日大概9.5年的數(shù)據(jù)進(jìn)行了歸檔,范圍包含就診、病歷、醫(yī)囑、檢查、護(hù)理、麻醉記錄單、特護(hù)單、治療記錄等9大類。歸檔的就診次數(shù)為772萬(wàn),注冊(cè)業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)條數(shù)為5050萬(wàn)。

在談及近期對(duì)于數(shù)據(jù)歸檔的規(guī)劃時(shí),鄭林介紹:“我們主要進(jìn)行兩方面的工作:一是優(yōu)化展示形式,實(shí)現(xiàn)網(wǎng)頁(yè)版及移動(dòng)端的CDR總覽,以便臨床可在外地進(jìn)行患者數(shù)據(jù)查看;二是區(qū)域數(shù)據(jù)歸檔,進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)醫(yī)聯(lián)體內(nèi)數(shù)據(jù)的共享與歸檔,實(shí)現(xiàn)區(qū)域內(nèi)CDR的總覽功能。”

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